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2011年7月，化学化工与生物工程学院开始制定考核方法和津贴分配方案，经过全院教职工几个月的讨论修改，并与意见比较大的老师展开对话，院教职工代表大会通过了“化学化工与生物工程学院岗位设置、聘任条件及考核办法”。学院党政班子成员、教授委员会委员、工会主席、系部主任和教师代表共19人组成聘任委员会，对全体教职工的岗位聘任进行无记名投票表决。
在卿凤翎看来，集体决策、按章办事和公开透明是学院管理必须坚持的基本原则。在制度和规则的实施过程中，学院管理者一定要提高自己的民主修养，学院班子成员尤其要心胸开阔，适应民主和集体决策对自己意见的否定。卿凤翎说：“可能会有院领导不适应，好像自己说话不算数了，这是教授治学的正常现象。学术归学术，行政归行政，院长们固然受到约束，但学院管理更科学了，老师们心里也服帖了，从事教学科研更有精神。”
徐明稚说，深化校院两级管理能更有效地实施分类指导，完善学院治理结构，是现代大学制度建设的需要。他表示，在加强学院能力建设的基础上，2013年，东华大学将在所有12个学院全面实施深化校院两级管理的改革。
