现代生物技术综合实训 内容简介
《现代生物技术综合实训》以基因工程、蛋白工程实验为基础,组成了生物工程中上游和下游技术。以绿色荧光蛋白的克隆、转化和原核表达作为一个整体实验,放弃了原先实训模式中单独小实验的结构,而改为一个独立的大实验,增强了学生的设计能力和主动性。这些实验既注重和加强了原来各自的实验内容,又注意到相互联系。 《现代生物技术综合实训》内容分为两个模块:*一模块包括基因工程的基本理论以及相应的实践操作;第二模块包括蛋白质工程的基本技术和实用技能综合性实验。这些实验采取大实验方法,使学生有一个完整的操作过程,对理解生物工程的上游、中游和下游技术有了感性认识。
现代生物技术综合实训 目录
模块一 基因工程
项目一 质粒DNA的抽提
项目二 琼脂糖凝胶电泳
项目三 PCR扩增
项目四 DNA片段的回收及纯化
项目五 大肠杆菌化学感受态的制备及转化
项目六 外源DNA片段的定向克隆
模块二 蛋白质工程
项目一 SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳
项目二 外源基因在大肠杆菌中的表达
现代生物技术综合实训 节选
《现代生物技术综合实训》: 质粒是携带外源基因进入细菌中扩增或表达的主要载体,它在基因操作中具有重要作用。质粒的分离与提取是*常用、*基本的实验技术。质粒的提取方法很多,大多包括3个主要步骤:细菌的培养、细菌的收集和裂解、质粒DNA的分离和纯化。本实验以碱裂解法为例,介绍质粒的抽提过程。 一、实验目的 了解碱裂解法制备质粒的原理,掌握质粒小抽的传统方法和商业化柱层析方法。 二、实验原理 从细菌(如大肠杆菌或枯草杆菌)中提取DNA的方法很多,其分离原理可根据.DNA分子大小的不同、碱基组成的差异以及质粒DNA的超螺旋共价闭合环状结构的特点来进行。目前常用的有碱变性法、酸酚法、PEG法、煮沸法以及溴化乙锭一氯化铯梯度离心法。这些方法各有利弊,有的操作烦琐,难以控制,有的纯度不够,有的需要昂贵的仪器。而碱变性法被认为是一种既经济,且DNA收得率又高的被普遍采用的提取方法。用这种方法提取的DNA可用于酶切、连接和转化。 碱变性法提取质粒DNA是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离的目的。在pH高达12.6的碱性条件下,染色体DNA的氢键断裂,双螺旋结构解开而变性。质粒DNA的部分氢键也断裂,但超螺旋共价闭合环结构的两条互补链不能完全分离,当以pH为4.8的NaAC缓冲液调节其pH至中性时,变性的质粒.DNA又恢复到原来的构型,保存于溶液中,而染色体DNA不能复性,形成缠连的网状结构,通过离心与不稳定的大分子RNA、蛋白.SDS复合物等一起沉淀下来而去除,从而达到分离的目的。后面可以采用传统的酚+氯仿抽提,酸性、低离子强度时超螺旋DNA在水相中,开环、线型分子在酚相中进行分离的酸酚法;利用商业化DNA结合柱只吸附DNA进行分离纯化。 (一)裂解细胞 裂解细胞是指通过溶菌酶、去污剂等试剂破裂细胞壁与膜的过程。对于不同的菌要选用不同的方法,通常有煮沸法、非离子型去污剂法、碱性SDS法(简称碱法)等。三种方法比较而言,非离子型去污剂法较温和,适用于抽提10kb左右的质粒;而煮沸法与碱性SDS法相对较剧烈,只能抽提小于10kb的质粒。常用的离子型去污剂是SDS、非离子型去污剂有Tritonx-100等。 (二)分离 将质粒DNA和细菌染色体DNA进行分离。碱裂解法的分离原理如下:大肠杆菌的染色体约有4700kb长,在处理细胞过程中都断裂成不同长度的双链DNA片段。在pH高达12的碱性条件下,双链DNA中的氢键被破坏,于是染色体DNA的双链分离成单链;而呈超螺旋状态的质粒DNA仅仅是氢键被破坏,并只发生部分双链解离成单链的变化。再当pH调回中性时,单链DNA互相缠绕且与蛋白质结合生成网络状大分子,而超螺旋的质粒发生复性反应后仍是小分子,通过离心的方法很容易将二者分开,达到分离的目的。 (三)纯化 细胞裂解液中的杂质除了染色体DNA外还有各种细胞壁、膜碎片、蛋白质、脂质类物质及RNA。纯化的步骤就是有针对性地将它们去除,RNA可用。RNaseA消化。其他杂质可用传统的采酚一氯仿方法抽提除去,残余的蛋白质可通过酚、酚.氯仿、氯仿一异戊醇,使蛋白质变性而除去,同时,氯仿有强烈的溶脂倾向,对于在除去蛋白质的同时去除脂质类杂质很有好处。氯仿还能将微量的、溶于DNA水溶液的酚抽提掉,而微量的酚对于以后的酶切、转化等过程都会产生不利影响。氯仿/异戊醇的蛋白质变性能力较弱,主要用于含酚试剂处理后的抽提。除了传统方法,现代生物技术发展,各种质粒小抽商业化试剂盒出现,使用DNA.的结合柱结合质粒DNA,同时去除杂质,*终获得纯化高的质粒DNA。 ……