PK/PD建模实践:NONMEM软件入门 本书特色
《PK/PD建模实践——NONMEM软件入门》在简要介绍定量药理学学科相关基本原理的基础上,紧密结合NONMEM 软件的应用,通过一系列群体药物动力学和群体药物动力学-药效动力学的实例,从数据需求、模型构建/评估到质量控制等角度进行了详尽的表述,包括相关数据的图像分析和数据集构建、建模和仿真的模型代码、模型的应用、模型结果的图形解析和各项内容的诠释以及模型评价等。《PK/PD建模实践——NONMEM软件入门》可供在新药研发、临床实践和药物监管中从事或关注定量药理学的研究人员或工作者参考使用。
PK/PD建模实践:NONMEM软件入门 内容简介
《/PD建模实践——NONMEM软件入门》在简要介绍定量药理学学科相关基本原理的基础上,紧密结合NONMEM 软件的应用,通过一系列群体药物动力学和群体药物动力学-药效动力学的实例,从数据需求、模型构建/评估到质量控制等角度进行了详尽的表述,包括相关数据的图像分析和数据集构建、建模和仿真的模型代码、模型的应用、模型结果的图形解析和各项内容的诠释以及模型评价等。
《/PD建模实践——NONMEM软件入门》可供在新药研发、临床实践和药物监管中从事或关注定量药理学的研究人员或工作者参考使用。
PK/PD建模实践:NONMEM软件入门 目录
第1章 定量药理学的应用 1
1.1 概述 1
1.2 稀疏数据分析的应用 2
1.3 定量药理学的影响 4
1.4 临床实例 5
参考文献 7
第2章 群体模型的概念及术语 9
2.1 概述 9
2.2 模型要素 10
2.3 个体模型 11
2.4 群体模型 12
2.4.1 固定效应参数 12
2.4.2 随机效应参数 13
2.5 个体间随机变异(L1)模型 16
2.5.1 加和型变异 17
2.5.2 比例型变异 17
2.5.3 指数型变异 18
2.5.4 针对个体间变异的来源进行建模 18
2.6 观测值中的随机变异(L2)模型 19
2.6.1 加和型变异 19
2.6.2 比例型变异 20
2.6.3 混合型变异 21
2.6.4 对数型误差模型 23
2.6.5 RV表达式与预测浓度之间的关系 23
2.6.6 RV大小的意义 25
2.7 估算方法 25
2.8 目标函数 26
2.9 贝叶斯估计 26
参考文献 26
第3章 NONMEM概述及NM-TRAN控制文件编辑 27
3.1 概述 27
3.2 NONMEM系统的构成 27
3.3 一般规则 29
3.4 控制文件的必需组件 30
3.4.1 $PROBLEM 30
3.4.2 $DATA 31
3.4.3 $INPUT 34
3.5 用NM-TRAN指定模型 34
3.5.1 为特定的PK模型调用PREDPP子程序 34
3.5.2 在$PK模块中指定模型 37
3.5.3 在$ERROR模块中指定残留变异 43
3.5.4 使用$PRED模块指定模型 47
3.6 以$THETA、$OMEGA和$SIGMA指定初始估算值 48
3.7 请求执行估算和相关选项 54
3.8 请求参数估算值的精度 59
3.9 控制输出 60
参考文献 62
第4章 数据集 63
4.1 概述 63
4.2 数据集的排列 64
4.3 数据集中的变量 67
4.3.1 TIME 68
4.3.2 DATE 68
4.3.3 ID 69
4.3.4 DV 70
4.3.5 MDV 71
4.3.6 CMT 71
4.3.7 EVID 72
4.3.8 AMT 73
4.3.9 RATE 74
4.3.10 ADDL 75
4.3.11 II 76
4.3.12 SS 77
4.4 灵活构建数据集以应用于各种替代模型 77
4.5 事件记录示例 77
4.5.1 指定时间的可选方式 77
4.5.2 输注和零级输入 78
4.5.3 ADDL的使用 79
4.5.4 稳态法 79
4.5.5 达稳态前后的样本 80
4.5.6 稳态方案中的计划外给药 80
4.5.7 给药间隔无规律的稳态给药 81
4.5.8 多种给药途径 82
4.5.9 多重因变量数据的建模 82
4.5.10 用于$PRED的数据集 83
4.6 给药和观测之外的内容 83
4.6.1 其他数据项 83
4.6.2 协变量随时间的变化 85
4.6.3 标题行的引入 85
参考文献 86
第5章 模型构建的典型流程 87
5.1 概述 87
5.2 分析计划 88
5.3 分析数据集的创建 89
5.4 数据集的质量控制 90
5.5 探索性数据分析 91
5.5.1 EDA：群体描述 91
5.5.2 EDA：剂量相关的数据 94
5.5.3 EDA：浓度相关的数据 95
5.5.4 EDA：大数据集的注意事项 105
5.5.5 EDA：总结 107
5.6 基础模型的构建 107
5.6.1 标准模型诊断图及其解读 108
5.6.2 随机效应的估算 119
5.6.3 参数估算值的精确度(基于$COV步骤) 125
5.7 协变量评价 126
5.7.1 协变量评价方法 128
5.7.2 协变量选择的统计基础 128
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PK/PD建模实践:NONMEM软件入门 作者简介
主要译者
1.卢炜：北京大学药学院教授、博士生导师。曾任北京大学药学院药剂学系主任，北京大学医学部学术委员会委员，医学部药学学科评议组和临床药学评议组成员，药学院学术委员会委员，北京大学治疗药物监测与临床毒理中心学术委员会副主任，中国药理学会数学药理专业委员会副主任委员，药学学报、中国药学杂志等多家学术刊物的编委。主持或作为主要参加者参与多项guo家级大型课题。主持由辉瑞资助的北京大学定量药理学培训中心，为社会培养输送从事药物动力学研究的高级人才。研究方向包括：①群体药物动力学(PopPK)：PopPK在临床药学中的应用；新药研发中PopPK的模型化与仿真；PK分析软件/工具的研制； ②药物动力学/药效动力学(PK/PD)：基于机制的PK/PD；连续型与非连续型数据的PK/PD；响应曲面模型在药物相互作用方面中的应用等。主要译者
1.卢炜：北京大学药学院教授、博士生导师。曾任北京大学药学院药剂学系主任，北京大学医学部学术委员会委员，医学部药学学科评议组和临床药学评议组成员，药学院学术委员会委员，北京大学治疗药物监测与临床毒理中心学术委员会副主任，中国药理学会数学药理专业委员会副主任委员，药学学报、中国药学杂志等多家学术刊物的编委。主持或作为主要参加者参与多项guo家级大型课题。主持由辉瑞资助的北京大学定量药理学培训中心，为社会培养输送从事药物动力学研究的高级人才。研究方向包括：①群体药物动力学(PopPK)：PopPK在临床药学中的应用；新药研发中PopPK的模型化与仿真；PK分析软件/工具的研制； ②药物动力学/药效动力学(PK/PD)：基于机制的PK/PD；连续型与非连续型数据的PK/PD；响应曲面模型在药物相互作用方面中的应用等。
2.周田彦：北京大学药学院教授、博士生导师。目前主讲北大医学部本科生课程《生物药剂学与药物动力学》、研究生课程《高等药物动力学》、清华大学八年制学生课程《药代动力学和药效动力学》。现任中国药理学会定量药理学专业委员会副主任委员，中国药理学会药物代谢专业委员会委员，北京药理学会药物代谢专业委员会副主任委员，药学学报、中国临床药理学与治疗学杂志编委。主持多项国家及北京市/教育部自然科学基金项目。研究方向包括：基于机制的药物动力学/药效动力学(PK/PD)；群体药物动力学；药物代谢酶诱导机理及功能。
