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当前，我国高等教育进入内涵式发展和全面提高质量的新阶段，协同创新则为高校科研改革创新指明了新的方向。
协同创新，要求高校之间以及学科之间的有效协同。人类进入知识经济时代，知识创造呈现出爆发式增长态势，科研成果转化周期缩短，不同学科加速交叉融合。尤其随着信息化、网络化等技术的发展，各种创新要素的流动越来越迅速、越来越普遍，科技和教育也越来越向着开放式、国际化方向迈进。在此形势下，各高校之间、各学科之间、自然科学与人文科学之间，应构建多学科交叉研究平台，并通过国内外高水平大学开展实质性合作，逐步培育出引领和主导国际科学研究与合作的学术中心。
协同创新，要求高校与经济社会发展的有效协同。紧密围绕国家急需的战略性问题、科学技术尖端领域的前瞻性问题、涉及国计民生重大问题的公益性问题、行业产业经济发展的关键性问题和区域发展的重大问题，加快高校与企业、科研院所联合建立多学科融合、多团队协同、多技术集成的重大研发与应用平台，形成产学研用融合发展的技术转移模式，为产业结构调整、行业技术进步、区域经济建设和社会发展，提供持续的支撑和引领。
协同创新，要求高校科研与人才培养的有效协同。高等教育的根本出发点和落脚点是人才培养，而培养应用型人才、复合型人才和拔尖创新人才离不开科研的支撑。高校应推进教育和科技的结合，提高学生的动手能力和创新本领，形成教学与科研互动的稳定机制，鼓励学生在学习中参与科研，在科研中深化学习。
协同创新，要求高校体制机制改革的有效协同。通过体制机制改革，打破高校科研封闭、分散、低效的格局，消除壁垒、理顺关系，推动资源共享，构建创新平台，促进创新要素的有机融合和全面共享。
协同创新，协同是手段，创新是目的。协同创新，要始终坚持人才培养、学科发展、科学研究和机制创新一体化的设计思路。以提升高校科研创新能力为突破口，通过协同，提升高校人才的创新精神，提升学科的创造能力，提升科研成果的创新水平，从而产生一大批标志性的科研成果，形成一批优质的创新团队，培养一批拔尖创新人才，为高等教育内涵式发展和质量的全面提高开拓更大空间，使高校在国家创新体系中发挥更大作用，努力为建设创新型国家作出积极贡献。
