生物医学工程学科实力很强的大学主要有东南大学、华中科技大学、上海交通大学、清华大学、北京航空航天大学、浙江大学、四川大学、北京大学、天津大学、复旦大学、华南理工大学等。
生物医学工程专业最好的大学
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 评选结果 |
| 1 | 10286 | 东南大学 | A+ |
| 2 | 10487 | 华中科技大学 | A+ |
| 3 | 10248 | 上海交通大学 | A |
| 4 | 10003 | 清华大学 | A- |
| 5 | 10006 | 北京航空航天大学 | A- |
| 6 | 10335 | 浙江大学 | A- |
| 7 | 10610 | 四川大学 | A- |
| 8 | 10001 | 北京大学 | B+ |
| 9 | 10056 | 天津大学 | B+ |
| 10 | 10246 | 复旦大学 | B+ |
| 11 | 10561 | 华南理工大学 | B+ |
| 12 | 10611 | 重庆大学 | B+ |
| 13 | 10614 | 电子科技大学 | B+ |
| 14 | 10698 | 西安交通大学 | B+ |
| 15 | 10005 | 北京工业大学 | B |
| 16 | 10007 | 北京理工大学 | B |
| 17 | 10213 | 哈尔滨工业大学 | B |
| 18 | 10252 | 上海理工大学 | B |
| 19 | 10590 | 深圳大学 | B |
| 20 | 12121 | 南方医科大学 | B |
| 21 | 90032 | 第四军医大学 | B |
| 22 | 10025 | 首都医科大学 | B- |
| 23 | 10141 | 大连理工大学 | B- |
| 24 | 10145 | 东北大学 | B- |
| 25 | 10226 | 哈尔滨医科大学 | B- |
| 26 | 10247 | 同济大学 | B- |
| 27 | 10358 | 中国科学技术大学 | B- |
| 28 | 10558 | 中山大学 | B- |
| 29 | 10559 | 暨南大学 | B- |
| 30 | 10062 | 天津医科大学 | C+ |
| 31 | 10284 | 南京大学 | C+ |
| 32 | 10343 | 温州医科大学 | C+ |
| 33 | 10422 | 山东大学 | C+ |
| 34 | 10699 | 西北工业大学 | C+ |
| 35 | 10701 | 西安电子科技大学 | C+ |
| 36 | 10112 | 太原理工大学 | C |
| 37 | 10285 | 苏州大学 | C |
| 38 | 10384 | 厦门大学 | C |
| 39 | 10486 | 武汉大学 | C |
| 40 | 10613 | 西南交通大学 | C |
