南开新校区自西向东总共由11个组团构成，其中由东西方向环一线与南北方向环二线两条校内环形道路，将11个组团有机串联起来。

3月先期搬迁，暑假学生搬迁

日前在南开大学津南新校区搬迁工作动员部署会上，南开大学新校区搬迁方案确定，共分四个阶段，2014年9月至11月的筹划阶段，主要是研究制定运行机制，建立组织，编制基本工作方案。2014年12月至2015年2月的启动阶段，基本完成家具、设备的招标工作。完成搬家公司、客运公司、物业公司等的招标。落实准备好所需搬迁物资。检查落实搬迁过程中存在的问题，加强督查。2015年3月至6月的先期搬迁阶段，各单位新配置的办公设备与家具分批搬入。分阶段完成所有新校区电话与网络安装。物业服务公司要做好先期进驻准备。安保系统的工作要先期到位并运转。2015年7月到8月的全面搬迁阶段，职能部处、专业学院、学生将在该阶段启动全面搬迁。各部门、各学院要利用夏季学期和暑假完成资料整理、教学科研设备、办公家具设备搬迁、调试、运行。

新学年南开将有11000名学生入住新校区开启全新的大学生活。历史学院、哲学院、法学院、周恩来政府管理学院、马克思主义教育学院、汉语言文化学院、旅游与服务学院、环境科学与工程学院、电子信息与光学工程学院、计算机与控制工程学院、软件学院、药学院、医学院、金融学院和材料学院15个专业学院将迁入，搬迁学院的新生将去新校区报到。

留在老校区的专业学院有：文学院、外国语学院、经济学院、商学院、数学学院、物理学院、化学学院、生命科学学院。

南开大学未来实行“一校三区”的运行模式，以新校区为主。根据“以新校区为主”的原则，学校行政中心设在津南校区。除个别机关部门因工作需要不搬迁外，其他机关各部门全部迁往新校区。机关各部门主要负责人原则上要在新校区办公，部门主要功能和业务要设在新校区。