合成生物学与合成酶学
合成生物学与合成酶学作者:张今 开 本:16开 书号ISBN:9787030339881 定价:86.0 出版时间:2012-04-01 出版社:科学出版社 |
合成生物学与合成酶学 本书特色
合成生物学的兴起是21世纪生命科学领域的大事件。合成生物学的快速发展为其他学科注入了新的研究理念,提供了强有力的工具。分子酶学工程与合成生物学的交叉和整合出现了新的研究领域——合成酶学。《合成生物学与合成酶学》共分7章。第1章合成生物学概述,使读者对合成生物学有一个全面的认识;第2章分子酶学工程概要,使读者对分子酶学工程与合成生物学的关系有基本的了解;第3章、第4章和第5章详细介绍了合成生物元件、装置、基因网路和系统;第6章介绍合成代谢途径;第7章介绍合成酶学。
《合成生物学与合成酶学》可供从事生命科学研究与教学的人员参考,也可用作生命科学学科专业高年级本科生及研究生的教材和参考用书。
合成生物学与合成酶学 内容简介
《合成生物学与合成酶学》可供从事生命科学研究与教学的人员参考,也可用作生命科学学科专业高年级本科生及研究生的教材和参考用书。《合成生物学与合成酶学》向读者提供了合成生物学的目前状况及其在分子酶学工程领域发展和应用的主线,内容涵盖概论、酶分子进化与设计、合成生物部件与组件、合成基因(或蛋白质)线路图、合成基因(或蛋白质)网路、合成生物系统、合成代谢、合成酶学等。
合成生物学与合成酶学 目录
前言第1章 合成生物学概述
1.1 合成生物学概念
1.2 合成生物学研究的核心内容
1.2.1 生物成分标准模块化设计和构建
1.2.2 中心法则的再设计和构建
1.2.3 生物网络的设计和构建
1.2.4 底盘基因组的设计和构建
1.2.5 基因组合成
1.3 合成生物学的研究策略和方法
1.3.1 合成策略和方法
1.3.2 分析策略和方法
1.4 合成生物学的应用研究
1.4.1 设计和构建新的生物大分子
1.4.2 设计和构建新的途径/网络
1.4.3 合成传感器
1.4.4 合成生物学用于药物发现、生产和治疗
1.4.5 合成生物学用于控制代谢流量
1.4.6 工程细胞
1.4.7 合成生态系统
1.5 设计与构建新的遗传系统
1.6 合成生物学面临的问题和挑战
1.6.1 表征、标准化和模块化
1.6.2 噪声的处理
1.6.3 表观遗传
1.6.4 计算工具
1.6.5 程序化抽提
1.6.6 合成生物学结果处理
1.6.7 元件不相容问题
1.7 社会及伦理问题
1.8 结束语
参考文献
第2章 分子酶学工程概要
2.1 引言
2.2 酶分子进化工程
2.2.1 酶定向进化
2.2.2 酶的混杂性和多专一性的进化及新酶设计
2.3 蛋白酶分子工程
2.3.1 DNA加工酶分子工程
2.3.2 结构域和模块工程
2.3.3 程序化合成酶和合成催化
2.4 核酸酶分子工程
2.4.1 基于基序体外选择核酶
2.4.2 DNAzyme——“生物学意义”的合成酶
2.5 酶分子的计算设计
2.5.1 酶活性部位的计算设计
2.5.2 配体进出路径的计算设计
2.5.3 蛋白质间相互作用界面的计算设计
2.5.4 正、负及中性突变的计算分析
2.5.5 酶稳定性的计算设计
2.5.6 展望
2.6 酶分子的从头设计
2.6.1 Kemp消除酶的从头设计
2.6.2 逆醇醛缩合酶的从头设计
2.6.3 Diels-Alder(狄尔斯·阿尔德)酶的从头设计
2.7 从工程酶到工程酶系统再到工程生命
参考文献
第3章 合成生物元件、装置和生物模块
3.1 引言
3.2 合成生物元件、装置、系统和模块的定义
3.2.1 元件
3.2.2 装置
3.2.3 系统
3.2.4 生物模块
3.2.5 生物骨架
3.3 合成蛋白质元件
3.3.1 蛋白质合成生物学基础
3.3.2 合成非天然蛋白质元件
3.3.3 基于基序合成蛋白质元件
3.4 合成蛋白质装置
3.4.1 基于分子相互作用合成蛋白质装置
3.4.2 基于结构域合成蛋白质装置
3.5 合成对RNA元件
3.5.1 RNA传感器
3.5.2 RNA调节器
3.6 合成RNA装置
3.6.1 传感器和调节器元件直接偶联的RNA装置
3.6.2 不同信息传递功能整合的RNA装置
3.6.3 功能组成骨架结构——模块组装装置
3.6.4 天然核开关
3.6.5 设计核酶和RNA逻辑装置
3.6.6 合成RNA装置的各种技术
3.6.7 合成RNA元件和装置的应用研究
3.7 合成DNA元件和装置
3.7.1 合成DNA元件库——iGEM Registry
3.7.2 合成启动子
3.7.3 合成动态DNA装置
3.8 结束语
参考文献
第4章 合成基因(或蛋白质)网络
4.1 引言
4.2 合成基因(或蛋白质)线路
4.2.1 逻辑基因线路
4.2.2 功能基因线路
4.3 合成基因(或蛋白质)网络
4.3.1 合成转录基因网络
4.3.2 合成转录后基因网络
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