巨野教案发生后，天主教会由于有本国军事势力做后盾和清政府地方官吏的悉心庇护，对中国人民的压迫、敲诈更加残酷，为所欲为，飞扬跋扈。张家庄常有教民指控某某为大刀会员，某某参加过杀教士事件，唆使清廷捕杀。有的教民还公开抢劫大刀会家属的财产，强迫他们为教会做苦工。正是在这种情况下，反教会侵略斗争的怒火又燃烧起来。巨野教案和翌年爆发的“大足教案”、“冠县教案”，堪称19世纪末揭开义和团运动序幕的三大教案。