按照各学校实施近代学制的起始时间，33所“百年学校”中有24所学校实施近代学制都发端于1900—1920年之间，除第一实验小学（国立北京高等师范学校附属小学）始建于1912年外，其余23所都集中于前十年间，在1900—1910年之间被冠以“小学堂”“中学堂”的名字，如宗室觉罗八旗中学堂（一中）、五城中学堂（北师大附中），畿辅学堂（十四中）、顺天府学（府学小学），京师女子师范学堂附属两等小学堂（第二实验小学），内务府三旗第六初等小学堂（皇城根小学），北洋官立第一小学堂（西城区顺城街第一小学），八旗第四高等小学堂（西四北四条小学），京师官立第一初等小学堂（宣武师范学院附属第一小学），北京地方官立小学堂（顺城街第一小学），健锐营高等小学堂（香山小学），宗室觉罗八旗第六高等小学堂（红庙小学），顺义高等官立高等小学堂（仁和中心小学），回民初等小学堂（昌平西贯市回民小学），黄村初级小学堂（大兴一小），密云高等小学堂（密云二小），延庆县高等小学堂（延庆一小）等。其余还有9所教会学校，除了鲁迅中学起源于1901年建校的笃志小学，其余8所教会学校最初多以蒙学馆的形式出现，但由于在传授教义之外均初见端倪教授简单的学科课程，如果以此判断他们实施近代学制的时间，那么这些学校多发端于1860—1870年代之间，包括蒙学馆（1864年，北京市第二十五中学）、贝满女校（1864年，第一六六中学）、崇德学校（1874年，第三十一中学）、潞河中学校（1867年，潞河中学）、美以美会蒙学馆（1871年，汇文中学）、（1864年，灯市口小学）、瞽叟通文馆（北京盲人学校）和蒙学馆（1871年，汇文第一小学）等。

    这33所学校的办学起源基本可以分为两类，即官立学校和私立学校。第一类为省、府、州等政府出资，1901年学制改革建立或更名的官立学校 ，占到33所学校的22所，如京师公立第一、二、三、四中学（北京市第一、二、三、四中学），公立巴氏觉罗学堂（前门小学），京师公立第十六初高级小学（金台书院小学），官立畿辅学堂（北京市第十四中学）等等。这些学校的办学主体大多是直隶省，多将原来的书院改为学堂或设立学堂，如畿辅学堂（北京市第十四中学）和五城学堂（北师大附中）；或是某一行政部门主办，如北洋提督衙门学塾（西城区顺城街第一小学）后改为北洋官立第一小学堂。

    第二类是属于私立学校，多由基督教天主教教会创办，为了传播教义，或为贫苦子弟开设的免除学费的启蒙教会学校，如育英男校（北京市第二十五中学、第六十五中学）、贝满女校（第一六六中学）、崇德学校（第三十一中学）、崇实中学（第二十一中学）等。民间募捐建立的私利学校有2所，如怀柔县高级小学堂（怀柔一小），西贯市清真寺初等小学堂（昌平西贯市回民小学）。

    可以看出，在实施近代教育的过程中，一方面清政府积极地进行学制改革，出资支持学校改制，显示了兴办教育推动社会发展的意识。另一方面，教会等私立学校也是一支不可忽视的力量。在中国教育近代化的过程中，私立学校如雨后春笋不断涌现，京师督学局统计，1906年至1908年间，京师督学局所属的私利小学堂从9所增加到93所，增加了足足九倍余,而官立和公立小学堂则分别增加了4所和2所。这些私立学校，大多引进西方课程，中西方教师兼收，培养了一批高素质的学生和教师，为探索近现代教育的培养方式，中国教育近代化起到了重要作用。